Les quatre genres peuvent etre groupés en deux tribus. Les 
Baselleae ont des filets dressés dans le bouton (
Basella, Tournonia, Ullucus), tandis que les 
Anredereae ont des filets courbés vers l'extérieur dans le bouton (
Anredera). 
Les Basellaceae ont longtemps été classé entre les 
Chenopodiaceae (G. Bentham and J. D. Hooker 1862-1883, vol. 3) et les 
Portulacaceae (A. P. de Candolle and A. L. P. P. de Candolle 1823-1873, vol. 3; G. Nageshwar and M. Radhakrishnaiah 1993). Depuis sa création en 1840, elle a fait l'objet de nombreuses études. Les analyses phylogénétiques classiques placèrent cette famille près des 
Didiereaceae (J. E. Rodman et al. 1984). Plusieurs études de l'ADN plastidien ont complétées cette conclusion en les rapprochant aussi des 
Portulacaceae et de certaines 
Cactaceae (M. W. Chase et al. 1993; S. R. Downie and J. D. Palmer 1994; S. R. Downie et al. 1997; J. H. Rettig et al. 1992). L'analyse morphologique des pollen a suggeré une relation proche entre les Basellaceae, les 
Didiereaceae et les 
Portulacaceae (J. W. Nowicke 1996). Enfin, certaines études anatomiques ont avancé l'idée que la paire de bractée serait en fait une paire de sépales et ques les segments périanthaires seraient donc de vrais pétales (H. P. Sharma 1961; C. R. Sperling 1987).